Desde que empecé a trabajar fuerte con prácticas de DevOps, hace unos 2 o 3 años que todos mis proyectos tienen al menos 3 repositorios.

El primer repositorio es el que almacena el código fuente de la aplicación. En realidad dependiendo de la complejidad del proyecto, puede que haya más de un repositorio para el código fuente.

El segundo repositorio es el almacena la configuración de la aplicación. Este repositorio tiene típicamente un 1 branch por ambiente. Hay que destacar que estoy branches nunca se mezclan, sino que evolución a la par. Cuando la aplicación requiere de un nuevo parámetro de configuración, el mismo debe ser agregado simultáneamente a cada uno de los branches con el valor correspondiente para el ambiente asociado.

Finalmente el tercer repositorio es el que contiene los scripts de deploy. Dependiendo de la infraestructura del proyecto puede que sean simplemente scripts de bash, ansible, puppet o similar.